为贯彻落实教育部“科学规划、共享资源、突出重点、提高效益、持续发展”的指导思想，2002年，我校以共享优质实验教学资源为核心，成立黑龙江中医药大学实验教学中心。真正实现了优化实验教学资源、优化实验室管理体制、优化实验内容与课程体系的“三优一化”实验教学模式。
2006年被评为全国医药类院校首批6个“国家级实验教学示范中心”之一。2016年学校获得国家一亿元高校基础建设经费，建成实训综合楼纳入中心，中心更名为实验实训中心。
经过20年的建设，中心规模不断壮大，教学面积达35170㎡，仪器设备6099台件，总价值达9565余万元。中药学实验教学中心、中医临床技能实验教学中心为省级实验教学示范中心。中心现有医学形态实验室、医学机能实验室、中药形态实验室、化学实验室、综合实验室、人体解剖组胚实验室、分子生物学实验室、大学生创新实验室、测试中心、综合实训部10个独立实验实训科室和6个虚拟仿真实验室。
同时具有一支高水平师资队伍，专职教师46人，其中博士22人（包括在读博士5人），硕士24人，具有正高级职称的是4人，副高级职称19人。
目前，中心已建立了“统建统管、科学合理、规范高效”的实验教学管理体制和运行机制，不断提升实验教学内涵建设，积极搭建实验教学、实训教学两大平台，为构建“一体两翼四平台”的实践教学体系提供有力支撑。
